Các chuyên gia cũng đã đưa ra những thách thức trong phát triển nông nghiệp ven đô hiện nay như: Một số mô hình sản xuất mới (doanh nghiệp nhỏ, doanh nghiệp liên kết,HTX..) đã hình thành nhưng mô hình hiệu quả chưa bền vững. Bên cạnh đó, việc đổi mới sản xuất các làng nghề còn thách thức giữa phát triển, ứng dụng kỹ thuật mới vào bảo tồn giá trị di sản, phát triển sản phẩm đặc thù kết hợp với du lịch, làng sinh thái...

Đa số các đại biểu đều cho rằng để phát triển nông nghiệp đô thị thực sự góp phần giảm ô nhiễm môi trường trong quá trình đô thị hóa, cần phải thực hiện một số giải pháp sau: Ổn định địa bàn sản xuất nông nghiệp đô thị; tiếp tục thực hiện có hiệu quả các chương trình, chính sách hỗ trợ và cho vay ưu đãi của Trung ương và Thành phố tập trung đầu tư hạ tầng kỹ thuật nông nghiệp, nông thôn; xây dựng các chương trình mục tiêu để tập trung phát triển giống cây con chất lượng cao, hoa cây cảnh, cá cảnh; đào tạo, phát triển nguồn nhân lực nông nghiệp; xây dựng chuyển giao công nghệ tiên tiến vào sản xuất, chế biến; xây dựng đăng kí nhãn hiệu...